Kegiatan pembiasaan pada pagi hari setiap hari dilakukan di SDN Sembungharjo 02. Adapun kegiatan yang dilakukan antara lain yaitu apel pagi, membaca Asmaul Husna, berdoa bersama, dan berjabat tangan bersama Bapak dan Ibu Guru. Kegiatan ini dilakukan untuk membentuk karakter para siswa.